Santa María de las Hoyas ist eine kleine nordspanische Gemeinde (municipio) mit 96 Einwohnern im Westen der Provinz Soria in der Autonomen Region Kastilien-León. Die Gemeinde gehört zur bevölkerungsarmen Serranía Celtibérica. Neben dem Hauptort Santa María de las Hoyas besteht die Gemeinde aus der Ortschaft Muñecas.